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#br * Prepare Climatology [#sc1ac203] #br まずはclimatologyの計算をしてみましょう．これは，境界条件... #br ** ROMS climatological run用のファイルの準備 [#e98f6554] - climatology用データファイルの確認 各自のhome directoryにDATAディレクトリを配置し，その中に... $ cd ~/DATA *** 1) SRTM30 Topography [#y6672b3f] ~/DATA/SIO_Topo/srtm30.nc グローバル水深データベース（30秒グリッド ~ 1 km） データソース： http://topex.ucsd.edu/WWW_html/srtm30_plus.html 同梱されているsrtm30.mは，生データをnetcdfに変換するmatla... *** 2) SCOW [#f90050e9] The Scatterometer Climatology of Ocean Winds by Risien an... 人工衛星（QuikSCAT）によるグローバルな海上風データベース． データソース： http://cioss.coas.oregonstate.edu/scow/ 使用するデータは，zonal（経度方向）およびmeridional（緯度... wind_stress_zonal_monthly_maps.nc wind_stress_meridional_monthly_maps.nc *** 3) SODA [#xba79e8a] Simple Ocean Data Assimilation （POPベースのグローバル海... SODA_1996_2007_monthly_clim.nc データソース： http://www.atmos.umd.edu/~ocean/ 以下のデータは，~/matlab/Roms_tools以下に配置されている． *** 4) COADS [#ja447f0e] グローバルな海上における各種フラックス（熱，放射，SSTなど... ~/matlab/Roms_tools/COADS05 フラックス等のデータ種類毎に別ファイルに分かれている． データソース： http://www.ncdc.noaa.gov/oa/climate/coads/ *** 5) Pathfinder AVHRR [#c6ff41b3] グローバルな海面水温データベース．人工衛星（Pathfinder）... ~/matlab/Roms_tools/SST_pathfinder *** 6) MSM [#s856d0c0] 気象庁メソ気象モデルGPV-MSM．気候値は整備中． #br ** グリッドファイルの作成 [#i43cb7e8] #br *** 1) easy grid (EGRID) [#ff913a1f] matlab用スクリプト「easy」を起動して，計算領域を設定する． $ cd ~/matlab/EGRID $ mat >> easy 領域の中心座標（緯度，経度で指定），x軸とy軸の長さ，格子... グリッドファイル「roms_grd.nc」が作られる．水深データには... >> nc=netcdf('jpcoast_grd.nc','w'); >> hraw=nc{'hraw'}(:); >> nc{'hraw'}(:)=-hraw; >> close(nc); 注意点：ROMSではインテル製CPUのパイプライン構造に最適化す... *** 2) editmask [#wa67cb29] 同じくmatlab用スクリプト「editmask」を起動し，詳細な海岸... $ cd ~/matlab/grid_tools/editmask $ cp -pv ~/matlab/EGRID/roms_grd.nc project_grd.nc $ mat >> editmask このとき，標準的なグリッドファイル名（roms_grd.nc）を，各... また，editmaskを起動すると，「ROMSグリッドファイル」と「... land maskは各格子点で定義されている，陸と海を判別するフラ... *** 3) extract_3sec_bath.m [#fa0bbc68] このスクリプトは，NOAA Coastal Reliefデータという３秒（約... 今回のclimatologyモデリングでは空間解像度が粗い（10 km前... *** 4) lsmooth [#w9006cb7] editmask（プラスextract_3sec_bath.m）の作業が終わったら，... $ cd ~/ROMS $ mkdir project1 $ cd project1 $ mkdir grid $ cd grid $ cp -pv ~/matlab/grid_tools/editmask/project_grd.nc . のように整理するとスッキリするかも知れない．さらに下記の... $ lsmooth 50 0.18 project_grd.nc 「lsmooth」はフォートランで書かれたスクリプトであり，グリ... *** 5) mod_cgrid.m [#j42b60c1] 親グリッド（SODAなどのグローバルデータや，ROMSによる親グ... #br ** 外力ファイルの作成 [#wdf4c968] #br *** make_frc_clim.m [#h5ad91e2] ~/ROMS/project1/bryに格納されているはず． COADS，Pathfinder，SCOWデータをROMSグリッド上にマッピング... frc_name これから作成するforcingファイルのパス（.... grdname もとになるROMS用グリッドファイルのパス（.... coads_dir COADSデータが格納されているディレクトリ... scow_zon, scow_mer SCOWデータ（zonal, meridional成分... sst_file Pathfinderデータへのパス ROMS_title このforcingファイルの説明（出力ncファ... これ以外はデフォルトのままでOK． #br ** 初期条件・境界条件ファイルの作成 [#h964e457] #br *** make_soda_clim_bry_ini_v2.m [#id848d0b] ~/ROMS /project1/bryに格納されているはず．SODAのmonthly c... bry_name これから作成するbryファイルのパス（./pro... ini_name これから作成するiniファイルのパス（./pro... grdname もとになるROMS用グリッドファイルのパス（.... coefmat 3次元補間係数のファイル（中間ファイル．RO... volcon = true 3次元流速と，水深平均流速との間... create_ini = true iniファイルを新規作成するかどう... create_bry = true bryファイルを新規作成するかどう... obc = [1 0 1 1] 開境界フラッグ．順番は[S E N ... scoord = 'NEW' 鉛直S座標の式（UCLA-ROMS用は必ず'N... N = 32 鉛直方向のメッシュ分割数 theta_s S座標の海表面付近の鉛直格子間... theta_b S座標の海底面付近の鉛直格子間... hc=200 混合層のおおよその厚さ．この水... soda SODAデータへのパス ROMS_title ini, bryファイルの説明（出力ncファイル...

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#br * Prepare Climatology [#sc1ac203] #br まずはclimatologyの計算をしてみましょう．これは，境界条件... #br ** ROMS climatological run用のファイルの準備 [#e98f6554] - climatology用データファイルの確認 各自のhome directoryにDATAディレクトリを配置し，その中に... $ cd ~/DATA *** 1) SRTM30 Topography [#y6672b3f] ~/DATA/SIO_Topo/srtm30.nc グローバル水深データベース（30秒グリッド ~ 1 km） データソース： http://topex.ucsd.edu/WWW_html/srtm30_plus.html 同梱されているsrtm30.mは，生データをnetcdfに変換するmatla... *** 2) SCOW [#f90050e9] The Scatterometer Climatology of Ocean Winds by Risien an... 人工衛星（QuikSCAT）によるグローバルな海上風データベース． データソース： http://cioss.coas.oregonstate.edu/scow/ 使用するデータは，zonal（経度方向）およびmeridional（緯度... wind_stress_zonal_monthly_maps.nc wind_stress_meridional_monthly_maps.nc *** 3) SODA [#xba79e8a] Simple Ocean Data Assimilation （POPベースのグローバル海... SODA_1996_2007_monthly_clim.nc データソース： http://www.atmos.umd.edu/~ocean/ 以下のデータは，~/matlab/Roms_tools以下に配置されている． *** 4) COADS [#ja447f0e] グローバルな海上における各種フラックス（熱，放射，SSTなど... ~/matlab/Roms_tools/COADS05 フラックス等のデータ種類毎に別ファイルに分かれている． データソース： http://www.ncdc.noaa.gov/oa/climate/coads/ *** 5) Pathfinder AVHRR [#c6ff41b3] グローバルな海面水温データベース．人工衛星（Pathfinder）... ~/matlab/Roms_tools/SST_pathfinder *** 6) MSM [#s856d0c0] 気象庁メソ気象モデルGPV-MSM．気候値は整備中． #br ** グリッドファイルの作成 [#i43cb7e8] #br *** 1) easy grid (EGRID) [#ff913a1f] matlab用スクリプト「easy」を起動して，計算領域を設定する． $ cd ~/matlab/EGRID $ mat >> easy 領域の中心座標（緯度，経度で指定），x軸とy軸の長さ，格子... グリッドファイル「roms_grd.nc」が作られる．水深データには... >> nc=netcdf('jpcoast_grd.nc','w'); >> hraw=nc{'hraw'}(:); >> nc{'hraw'}(:)=-hraw; >> close(nc); 注意点：ROMSではインテル製CPUのパイプライン構造に最適化す... *** 2) editmask [#wa67cb29] 同じくmatlab用スクリプト「editmask」を起動し，詳細な海岸... $ cd ~/matlab/grid_tools/editmask $ cp -pv ~/matlab/EGRID/roms_grd.nc project_grd.nc $ mat >> editmask このとき，標準的なグリッドファイル名（roms_grd.nc）を，各... また，editmaskを起動すると，「ROMSグリッドファイル」と「... land maskは各格子点で定義されている，陸と海を判別するフラ... *** 3) extract_3sec_bath.m [#fa0bbc68] このスクリプトは，NOAA Coastal Reliefデータという３秒（約... 今回のclimatologyモデリングでは空間解像度が粗い（10 km前... *** 4) lsmooth [#w9006cb7] editmask（プラスextract_3sec_bath.m）の作業が終わったら，... $ cd ~/ROMS $ mkdir project1 $ cd project1 $ mkdir grid $ cd grid $ cp -pv ~/matlab/grid_tools/editmask/project_grd.nc . のように整理するとスッキリするかも知れない．さらに下記の... $ lsmooth 50 0.18 project_grd.nc 「lsmooth」はフォートランで書かれたスクリプトであり，グリ... *** 5) mod_cgrid.m [#j42b60c1] 親グリッド（SODAなどのグローバルデータや，ROMSによる親グ... #br ** 外力ファイルの作成 [#wdf4c968] #br *** make_frc_clim.m [#h5ad91e2] ~/ROMS/project1/bryに格納されているはず． COADS，Pathfinder，SCOWデータをROMSグリッド上にマッピング... frc_name これから作成するforcingファイルのパス（.... grdname もとになるROMS用グリッドファイルのパス（.... coads_dir COADSデータが格納されているディレクトリ... scow_zon, scow_mer SCOWデータ（zonal, meridional成分... sst_file Pathfinderデータへのパス ROMS_title このforcingファイルの説明（出力ncファ... これ以外はデフォルトのままでOK． #br ** 初期条件・境界条件ファイルの作成 [#h964e457] #br *** make_soda_clim_bry_ini_v2.m [#id848d0b] ~/ROMS /project1/bryに格納されているはず．SODAのmonthly c... bry_name これから作成するbryファイルのパス（./pro... ini_name これから作成するiniファイルのパス（./pro... grdname もとになるROMS用グリッドファイルのパス（.... coefmat 3次元補間係数のファイル（中間ファイル．RO... volcon = true 3次元流速と，水深平均流速との間... create_ini = true iniファイルを新規作成するかどう... create_bry = true bryファイルを新規作成するかどう... obc = [1 0 1 1] 開境界フラッグ．順番は[S E N ... scoord = 'NEW' 鉛直S座標の式（UCLA-ROMS用は必ず'N... N = 32 鉛直方向のメッシュ分割数 theta_s S座標の海表面付近の鉛直格子間... theta_b S座標の海底面付近の鉛直格子間... hc=200 混合層のおおよその厚さ．この水... soda SODAデータへのパス ROMS_title ini, bryファイルの説明（出力ncファイル...

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